UniGeneクラスタ検索 (UniGene Cluster Search & Listing)

・ゲノム上の各種マーカによる検索 ・配列の由来組織での検索

サブクラスタ検索 (Subcluster Search & Listing)

クラスタ・オーバービュー(Cluster Overview)

・サブクラスタに関する情報を整理 ・NCBI nrデータベースへのBlastx結果からを明示 ・mRNA配列を含むサブクラスタを明示 ・サブクラスタ上に位置付けられるSNP情報を明示

サムネイル・ウインドウ

対象となるUniGeneクラスタに属するサブクラスタの一覧をアライメント概略図とともに表示します

サブクラスタビューア

・エクソンバウンダリの明示 ・プライマーデザインとの連携 ・自由度の高いビューアレイアウト機能 - 表示[24KB] ・SNPに関する詳細情報の掲示-SNP詳細情報画面[27KB] ・モチーフ検索を利用したランク分け情報 -SNPランク画面 ・コンセンサス配列のゲノムマッピング結果とリンク ・タンパク質立体構造提示(SNPの位置明示)リンク*オプション

ゲノムビューア

・配列情報を確認できる - 表示[23KB] ・estのアライメント情報を確認できる - 表示[35KB]

Blast Search Tool

・Blastの全てのオプションパラメータが利用可能

Primer Design Tool

・Primer3の全てのオプションパラメータが利用可能

Genome Sequence Finder Options

・コンティグ上の位置、または染色体上の位置情報からその位置のゲノム配列を切り出す